Jonathon Emile "Jon" Flanagan (sinh ngày 1 tháng 1 năm 1993) là cầu thủ bóng đá Anh gốc Ailen chơi cho Liverpool trong vị trí hậu vệ cánh. Anh ra mắt lần đầu trong trận thắng 3-0 trước Manchester City vào ngày 11 tháng 4 năm 2011. Anh là cháu trai hậu vệ cánh phải Bradley Orr của đội Blackburn Rovers. Anh đã có bước đột phá trong cuối mùa giải 2010-11, với một chuỗi các trận đấu có phong độ tốt.Trận gặp Southampton tại vòng 31 NHA mùa 2015/2016, Jon Flanagan lần đầu tiên đeo băng đội trưởng thay cho Jordan Henderson ngồi dự bị.